晚號大隱翁，因曾官奉議郎，人稱朱奉議。吳興（今浙江湖州人），元祐三年（1088）進士，但無意為官，退而釀酒著書，其間對《傷寒論》深有研究，值朝廷重視醫學，遍求精於醫術之人，朱肱遂被征為醫學博士，後因書蘇東坡詩獲罪，被貶于達州（今四川達縣），次年還為朝奉郎提點洞霄宮。

朱肱研究傷寒最重經絡，認為不識經絡，則猶觸途冥行，不知邪氣所在。在用經絡循行部位和生理特點解釋傷寒傳變的同時，還特別強調脈證合參以辨別病證的表裡陰陽。他對外感熱病分類命名，施以不同方藥，在鑒別診斷和治療方面具有獨到見解。

朱肱先于大觀二年（1108）著成《傷寒百問》一書，流傳過程中漸有殘缺。至大觀五年（1112），張蕆據朱肱親傳繕本予以修訂增補，終成20卷，改稱《南陽活人書》。除此之外，還輯有《內外二景圖》。