瘴氣亦名瘴毒。此特指嶺南地區引致瘴疾、障瘧之毒氣，非一般山嵐瘴氣之謂。《病源，障氣候》謂其發病自仲春迄仲夏，以至季夏、孟冬，皆可有發作，"猶如嶺北傷寒也"。若久治不愈可成黃疸，黃疸不治則成"屍疸"。"屍疸疾者，嶺南中瘴氣，土人連歷不痿，變成此病"，並列屬於《疫癘病候》之中。於《瘧病諸候。山瘴瘧候》中又說："此病生於嶺南。帶山瘴之氣。其狀發寒熱，休作有時。皆由山溪源嶺瘴濕毒氣故也"。並指出"其病重於傷暑之瘧"。