應用經絡學說，可以解釋臨床上常用的許多針麻穴位的原理。例如，臨床上有「面口合谷收」的經驗之談，合谷穴被廣泛應用於面頰、鼻唇、口腔和頸部手術。這是因為合谷穴屬於手陽明大腸經，該經循行到達鎖骨上窩時，發出支脈上至頸部，進而通過面頰進入下齒齦，再繞唇到達對側鼻翼旁。又如胃大部切除朮多取足三里穴。這是因為該穴屬足陽明胃經，而後者直接連屬於胃腑。

由於經絡之間、臟腑之間是彼此關聯并相互影響的，更兼病人的病情、體質各異，手術前和手術過程中出現的徵候複雜多變，因此，除了循經取穴以外，通常還考慮辨證取穴原則。所謂辨證取穴，是應用臟腑經絡辨證方法，根據病人的體質、病情、病變所涉及的臟腑、術中可能出現的各種證候，以及臟腑間或臟腑經絡間相關等原則，選取相應穴位。例如胸腔內手術常選用郄門穴，乃是該穴屬心包經之故。心包和心的功能相仿。在手術過程中，病人可能出現心悸、氣急、煩躁等反應，究其原因，是由於心氣受擾，而針刺郄門穴則可收到寧心安神之功。又如耳針麻醉的穴位處方多包含肺穴，乃是多數手術要切開皮膚，而依據了「肺主皮毛」(《素問‧陰陽應像大論》)原理。

關於針刺作用特點的研究，進一步深化了人們對經絡學說的認識。例如，臨床發現，針刺誘導後末梢血管擴張、脈搏波增大、微循環改善者，針麻效果較好，反之則較差。這就從一個側面反映了針刺通調經絡氣血的實質。又如，由於「諸痛皆因於氣」(張子和‧《儒門事親》)，而「肺者，氣之本」(《素問‧六節藏象論》)，肺司呼吸，因而可通過記錄呼吸運動以反映針刺後臟腑經絡氣血的活動狀態。結果表明，針刺時呼吸均勻、幅度平穩者，針麻效果較好。再如在手術前對病人進行辨證分型，探討針麻作用的個體差異，結果發現，虛寒型病人的針麻效果優于實熱型。有的單位根據辨證的結果，給病人服中藥進行調理，爾後再進行手術，據報導可提高針麻效果。