凡已归属于十四经系统内的穴位称十四经穴位，简称“经穴”。早在内经中，对穴位的分经已奠定了基础，如灵枢‧本输、素问‧气府论等都有分经论穴。后来明堂孔穴一类书籍，对各经穴位有了全面的记载。据晋代皇甫谧针灸甲乙经转载明堂孔穴的穴名总数为349。宋代王惟一铜人腧穴针灸图经增至354，并对穴位的归经和排列顺序进行了较为全面的整理。以后，宋代王执中针灸资生经以至清代的针灸著作又略有增加，穴名总数为361。历代增加的穴数见下表：

铜人腧穴针灸图经增入单穴2：灵台、腰阳关；双穴3，即厥阴俞、膏肓俞、青灵。至针灸资生经（明‧针灸大成同）再增入双穴5，即眉冲、督俞、气海俞、关元俞、风市。元十四经发挥较铜人增中枢一穴。明类经图翼因增加单穴1，即中枢；双穴1，即急脉。但未列入资生所增各穴。清‧医宗金鉴仍遗漏眉冲；至李学川针灸逢源才汇集各穴确定为361经穴。

属于同一经络的穴位，其治疗作用往往有着一致性。尤其是四肢肘、膝以下的穴位被列为十二经脉的基本要穴。十二经脉的命名，各分手足三阴、三阳而连接脏腑，就是表示了四肢经穴对于头身脏腑的远道治疗作用。内经论述针灸治疗时，常只举经名而不列穴名，即以经络来概括穴位。说明当时已深入掌握了穴位的一定规律性，在理论方面已趋于系统化。