1996年，世界衛生組織(WHO)根據嚴格的臨床驗證，認可了64種針灸適應症，分為9大類，如下：

在中醫聖典《黃帝內經》的《經脈》篇當中記載了人體12條經脈所主的病症共158項，據統計，一般內科病症佔73%，經脈循行所過的病症(包括筋骨痠痛)佔27%⁽¹⁾。所以，即便在古代，針灸的主要適應症還是內科疾患，而非只是筋骨痠痛。

傳統中醫認為，內在臟器與皮膚、血管、神經、肌肉、骨髓、乃至五官等等組織是息息相關的，其間透過經絡網路(見「何謂經絡、穴道？」一節)相聯繫。經絡可視為臟腑所延伸出的觸角，內臟有病會反應在經絡上，經絡若阻塞也會影響內臟的機能。因此之故，針刺經穴不但可治療經絡所經過的筋骨、皮毛等等組織的疾患，主要還在調整臟腑的機能，令恢復平衡。臨床經驗與WHO的認可都證明了這種觀點。

古醫諺云「一針，二灸，三用藥」，無論何種疾病(包括癌症)皆可針灸，效果往往立竿見影，配合中藥更如虎添翼。然而在台灣，健保局將針灸歸為傷科之流，給付甚低(每次治療的實際給付不到NT$200；在美國，針灸一次得花費上千台幣)，意即，在健保局的認知，針灸只能治筋骨痠痛。一般民眾也普遍以為，針灸就只能治痠痛，且哪痛扎哪。許多中醫師不知為何，竟也順應健保局與一般民眾的認知，哪痛扎哪，剩下的就交給推拿師處理。許多看內科的醫師只處方開藥給患者，也不太針灸。針灸術沉淪至此，只能一嘆。

1. 根據沈邑穎中醫師的統計。