祖籍撫州（今江西撫州市西），後遷南豐（今江西南丰縣），出身子世醫家庭，高祖危云山隨董奉二十五世孫董京習大方脈（內科），爾後醫道五世不衰。其伯祖危子美專婦人及正骨金鏃等科。其父危碧崖，隨周伯熙習小兒科，進而學眼科，兼療瘵疾。危亦林自幼好學，20歲開始業醫，除繼承祖傳醫術外，還研究瘡腫、咽喉、口齒等科，醫術全面，而以骨傷科最有成就。於1337年撰成《世醫得效方》19卷。經太醫院審問後，於1345年刊行。

《世醫得效方》的骨傷科成就，代表了金元時期中國骨傷科的發展水準，居於當時世界醫學的前列。