肝臟本身雖無法直接調控胃腸的蠕動，但可「間接」影響胃腸。當脂肪送抵十二指腸，後者便會分泌膽囊收縮素，刺激膽汁、胰液的排放，幫助脂肪的分解吸收，膽囊收縮素還會抑制胃排空、產生飽足感。若肝功能差、膽汁分泌少，脂肪的消化、吸收也會變差，脂肪就會較長時間停留在腸道、持續刺激腸道分泌膽囊收縮素，這會令胃部的蠕動持續受到抑制，食物因而在胃內積累，產生發酵脹氣、胃酸過多等種種胃部不適的症狀。這是一種肝氣犯胃，此肝氣源於肝臟本身，特徵是吃油膩的胃就脹，不吃油膩的就不脹，此外，右脅肋可能會悶痛，脈象未必弦緊。

當食物進入腸道，腸道便會分泌多種激素幫助消化，這些激素也會抑制胃的蠕動與排空。若腸道的消化力弱，食物較長時間堆積在腸道內，持續刺激腸道產生各種消化激素，這會持續抑制胃的蠕動與排空，產生種種胃部不適的症狀。若腸道的消化力變弱是因為自律神經的調控失常所引起的，這是另一種肝氣犯胃，此肝氣源於自律神經的失調，特徵是明明有細嚼慢嚥，但還是餐後胃就脹，與吃啥種類食物無關，此外還可見脈象弦緊，或心情鬱悶、或煩躁易怒的情志症狀。