三山（今福建省福州市）人，出身於世醫家庭，自幼習醫，對《內經》、《難經》、《傷寒論》等古典醫籍及歷代醫學名著研究頗深，在脈學、傷寒、兒科及內科雜病方面有一定成就，所撰《傷寒類書活人總括》7卷，乃總括張仲景《傷寒論》及朱肱《類證活人書》，並參附自己的學術見解而成，每條都冠以歌訣，便於後學記誦，其《亡齋直指方論》26卷，融會前人效方及自家經驗，據證釋方，對內科雜病證治作了綜合論述，示讀者以規矩準繩。後世將以上三書合刊，名為《楊仁齋著作三種》。除此之外，楊氏還撰有《醫學真經》、《察脈總括》等，今佚。