所谓素因，就是人体禀赋素质，包括人体脏腑功能活动的健全情况，以及人体自身所具备的天然的抗病能力和康复能力，统谓之正气。在一般情况下，人体正气对于疾病的发生起决定作用。当禀赋素盛，体质强壮，抗病力强，也就是正气旺盛之时，虽有邪气侵袭，人体正气自然与之进行斗争，并最终抑制和消灭之，使邪气丧失致病能力，而免于发病，这叫做"正气存内，邪不可干"。只有当正气虚弱，抗病能力低下时，邪气才能发挥其作用而导致发病。诚如《灵枢‧百病始生》篇说："风雨寒热，不得虚邪，不能独伤人。卒然逢疾风暴雨而不病者，盖无虚，故邪不能独伤人。此心因虚邪之风，与其身形，两虚相得，乃客其形"。《素问‧评热病论》说："邪之所凑，其气必虚"。不同的体质《素问‧评热病论》说"邪之所凑，其气必虚"。不同的体，其正气盛衰的情况不同，发病也不一样。《灵枢‧五变》篇说："肉不坚，腠理疏，则善病风……五脏皆柔弱者，善病消帅……粗理而肉不坚者，善病痹"。这里指出脏腑组织坚脆刚柔不同的人，其发病情况即有所差异。小儿脏腑娇嫩，形气未充，心神未健，卫外机能较弱，易招致外邪而发病，发生高热、惊风之候。先天禀赋不足，早产或后天乳养不良，易发生何楼、五迟(立迟、行迟、发迟、齿迟、语迟)、五软(头软、项软、手足软、肌肉软、口软)等证。妇女以血为本，由于月经、胎孕、产育都是以血为用，所以易发血虚、血瘀之证，同样感受温邪，因患者正气盛衰不同，发病有顺传和逆传之异。同样感受湿温之邪，叶天士《外感温热篇》指出："在阳旺之躯，胃湿恒多；在阴盛之体，脾湿亦不少"。同是外感温疫，吴又可在《温疫论》中指出有九种传变，说："传变不常，皆因人而使"。这些都说明正气在发病中起决定作用。但是，在某些特殊的条件下，邪气对发病又起决定作用。如《素问‧刺法论》指出："五疫之至，皆相染易，无问大小，病状相似"。说明某些疫病邪气引起传染病的发生，病邪又是起决定作用的。此外，各种外伤、水火烫伤、虫兽毒蛇咬伤等，也是病因在发病中起了决定作用。总之，原因、诱因和素因在发病中的作用，要辩证地看，才能更好地理解发病过程。