六气司天在泉的偏胜情况，也会影响自然气候变化和人体发病。司天主上半年发病，在泉主下半年发病。
子午之年，为少阴之气司天，则热气偏胜，气候酷热，火气行其政令，人体多病胸中烦热、咽干、右胁痞满、皮肤疼痛、寒热、咳喘、唾血、下血、助藏、喷嚏、呕吐、小便变色，甚至疮疡腑肿、肩背臂膈以及缺盆等处皆痛，心痛，肺部胀满，腹部膨胀而喘咳等。这些都是由于热气太盛，热伤肺金，致肺热及肺经脉络循行部位受伤所发生的一系列症状。少阴司天如下半年阳明在泉之气偏胜，则燥气太盛，天地霜雾之气昏蒙，发热多见呕吐苦味、善太息、心胁痛不能转侧等肝胆木气的病变，燥甚则伤津故口干，皮肤及面干枯不泽等，以及燥伤阳明经脉，则见足外反热等症状。
丑未之岁，太阴之气司天，则湿气偏胜，阴埃密布，雨水过多，草木腐槁。其发病多见皮肤肿，骨节酸痛而不知痛处，发为阴痹，腰脊头项俱痛，眩晕，大便难，阴气不用，不能上交于心，而上焦火热留于胃，胃热则消谷善饥，然胃气上逆则不欲食，当其湿气化热之时，热伤肺络则咳嗽带血，肾心不济则心如悬等，这些都是由于湿盛伤肾研发生的病变。其下半年，为太阳在泉之气所主，则寒气偏胜，天气凛冽，寒气内侵，发病多见小腹疾病，牵引睾丸腰脊、上冲心痛、嗌痛颔肿等疾病，皆为寒伤太阳膀胱经脉所致，且因水邪过胜‧故涉及心和小肠等藏器的病变。
寅申之岁，少阳之气司天，则火气偏胜，金失清肃之气，火性炎上，故发病多见头痛、发热、恶寒而为疟疾。热气上蒸则皮肤疼痛，色变黄赤，病传于里，肺之治节不行，发为水病，形成身面浮肿、腹部仰息等症状，以及注泄、亦自痢疾、疮疡、咳嗽、吐血、烦心、胸中热，甚至鼻蛆等。这些都是由于邪热伤肺，致清肃之令不行所产生的病变。下半年为厥阴在泉之气，所主风气偏胜，尘土飞扬，地气不明，平野昏昧，草木秀丽较早，故发病多见洒洒然怕冷、胸中烦闷、善伸数欠、心痛支满、两脇拘急不舒、饮食不下、膈咽不通、食后呕吐、腹胀而时噫气、得大便疏利或矢气则感觉较快，以及全身有沉重的感觉等症伏。这些都是出于胆经受伤以及肝木克土研发生的病变。
卯酉之岁，阴明之气司天，则燥气偏胜，草木失濡润之气，所以繁荣较迟，病多在筋骨，肝气受制则见左胁疼痛，清寒之气偏盛于中，若复感外寒则发为疟、咳嗽、腹鸣、暴注泄泻、心胁突然剧痛、咽嗌干燥、面色如尘、腰痛、男子则发癫疝、妇女则少腹痛、眼目昏昧不明、眼角疼痛、疮疡痈座等等。这些病都是由于燥气伤肝所引起的。其在泉之气为少阴君火，热气过胜，则热邪内迫，故发病多见腹鸣、气上冲胸、喘而不能久立、寒热皮肤痛、目昏齿痛、眼下肿、恶寒发热如疟、小腹痛、腹部胀大等症。辰戌之岁，太阳之气司天，则寒气淫胜，天寒地冻，太阳中藏相火，如又遇戊癸化火之运，则暴雨冰雹，寒则血凝，故多见痈疡、厥逆、心痛、呕血、下蛆血等病，以及善悲，时常眩晕仆倒、胸腹满、手热、肘挛腋肿、心中劝荡不安、胸腹胃脘不适、面赤目黄、善噫嗌干、甚则其色焦黑，渴欲钦水等等。这些都是由于寒气伤心化热所产生的病变。其在泉之气为太阴湿土，湿气偏胜，雾气弥漫，岩谷昏暗，长夏季节至阴之交，在人则因湿胜阳衰，故多病饮邪停聚、心席、耳聋不聪，湿热相蒸则发为咽肿、喉痹，阴病见血如吐血、便血、溺血等，或小腹胀痛，不得小便；湿邪上冲则病头痛、目痛如脱、项部掣痛、腰痛如折、鹊骨疼痛不能回转、膝弯小腿部疼痛拘急等症状，皆为湿邪所致。
己亥之岁，厥阴之气司天，则风气淫胜，天空尘埃蒙昧，风起云涌，扰动不宁，寒气行春令，流水不能结冰，蛰虫不去潜伏。在这种气候环境下，发病多见胃心部疼痛、上连两脇、膈咽阻塞不通、饮食不下、舌根强硬、食入则吐、不能消化水谷而为冷泄、腹胀大、溏泄及气结成瘦、小便不通等症状。这些都是属于风木克脾、脾土受伤所产生的症状。其下半年之气，为少阳相火在泉，火气过胜，热蒸地面，极而生寒，寒热相互而至，故令人体发病多见泄下赤白、小腹痛、溺赤，甚则便血，其余和少阴在泉问候。从上述可见，司天在泉不同，六气变化各界，因此引起人体藏气的发病也有不同，但都是以五行生克理论来说明。如少阴君火司天，则火旺克金，多见肺病；阳明在泉，则燥气太过，金气克木，故肝病较多等。
此外，运和气相结合的顺逆，也与气候变化和发病相关。运气相合的顺逆是根据每年年号的干支之间相生相克的理论来推算的。在分析二者的关系时，以气为主，故气生运者为"顺化"，气克运者为"天刑"，均为顺；反之，运生气者为"小逆"，运克气者为"不和"，运气相同者为"天符"，均为逆。一般说来，运气相合为顺者，则气候变化较为缓和，发病较少较轻运气相合为逆者，则气候变化较为剧烈，发病较多较重。六气的客主加临关系与发病也密切相关。主气在地，客气在天，二者上下相交，可以推测每年气候变化的常和变。推算每年客主加临的顺逆，以客气为主。从五行关系来分析，凡是客气胜主气者为顺，反之则逆。如客气生主气或客气克主气的为顺，反之则逆。客主加临除了顺逆之外，还有客气和主气既无生克、又无君臣差异的，称为同气。客主加临的顺、逆、同化情况，"顺"是代表气候变化不大，"逆"是代表本步气候变异较大，"同化"是代表气候变化特别剧烈。这些气候变化与人体发病的关系，正如《素问五运行大论》说："气相得则和，不相得则病"。故据此可推断客主加临的发病概况。
综上所述，运气学说强调"人与天地相应"的发病理论，可以作为分析自然气候变化和发病情况的参考。但是，运气学说中"五运相袭"，"周而复始"、"如环无端"的认识，带有主观臆测和脱离实际的偏向，应以"一分为二"的观点来对待和研究它，在继承的基础上加以发扬和提高。