少阳病机变化，实以胆、三焦为基础。少阳与厥阴互为表里，其经脉循人身之两侧，是半在外、半在里的病理反应层次。其外邻太阳、阳明，内近三阴，为病邪从外入里，由阳入阴，或自里出外，由阴传阳的枢机。少看微少之意，意味着阳热不如太阳、阳明之亢旺，故称少阳病。邪气与正气分争于内外之间，相持不下，致使枢机不利，为少阳病的基本病机。少阳病的传变由来，有邪自表入者，如《伤寒论》第267条"本太阳病，不解，转入少阳者"即是；有本发于少阳者，如《伤寒论》第266条"伤寒，脉弦细，头痛发热者，属少阳"即是。少阳病失治或误治，其传变与否的关键在脾胃的虚实。《伤寒论》第270条"伤寒三日，三阳为尽，三阴当受邪，其人反能食而不呕，此为三阴不受邪也"。其能食而不呕，表明脾胃不虚，故不传三阴。一般说，脾胃阴盛，则易入三阴之藏；胃实阳盛，则易传阳明之腑。如正气太虚，邪气太盛，病可自少阳而逆传厥阴；厥阴阳复热盛，亦能转属少阳，为预后之佳兆。因少阳厥阴互为表里，故有"少阳虚则是厥阴，厥阴实则是少阳"之说。

少阳病属三阳范畴，亦有经证、腑证的病埋演变。邪气侵犯少阳领域，胆火上炎，胆气不降，胃气上逆，即《灵枢》所谓"邪在胆，逆在胃"，以及枢机不利，正邪分争于内外之间，相持不下。此为少阳经证的病机变化。而少阳腑证必在胆腑。《伤寒论》第106条"……呕不止，心下急，郁郁微烦者，为未解也，与大柴胡汤下之则愈。"第170条"……心下痞鞭，呕吐而下利者，大柴胡汤主之。"就是属热结胆腑的病机变化。因少阳胆经之脉"下胸中，贯膈，络肝属胆"，故胆腑位于心下。所谓"心下急"、"心下痞鞭"，显然与胆腑气机郁滞有关，实际上就是少阳腑证。过去有人认为大柴胡汤证属少阳阳明并病，但其证三条(106、140、170条)均无胃肠燥结，大便不通的症状，可见病未涉及阳明。病不在阳明而用大柴胡汤下之，是藉通下利导以泄胆腑结热之义。少阳经证禁下，而腑证则不禁下。