太陰主脾所生病，其位在裡，虛寒初盛於裡，始病三陰，故稱之為太陰病。而脾胃虛寒，也就是太陰病的基本病機。

太陰病的傳變由來有三：一為"藏有寒"，邪氣直中太陰；二為太陽病誤下，脾陽受戕而成，《傷寒論》279條"本太陽病，醫反下之，因爾腹滿時痛者，屬太陰也。"即是；三為陽明攻下太過，損傷脾陽，可轉化為太陰。而太陰過用溫燥，亦可轉屬陽明，是太陰脾與陽明胃互為表裡之故。《傷寒論》第192條"傷寒，脈浮而緩，手足自溫者，是為係在太陰……至七八日，大便鞭者，為陽明病也。"就是太陰、陽明互相傳變的病機。故有虛則太陰，實則陽明之說。如太陰不治，吐利不止，陽亡液脫，則傳少陽、厥陰，病勢更加危重。