少阳主一身之枢机，三焦"主持诸气"(《难经‧三十八难》)，又为"决渎之官，水道出焉"(《素问‧灵兰秘典论》)，是人体化气行水和气机升降出入的通路。论其部位层次，又主一身之半表里。湿热兼挟痰饮水湿，或湿热、暑湿留滞三焦，郁阻少阳，或伏踞膜原，均可引起三焦气化失司，气机阻滞和少阳枢机不利。病邪既不能外出于表，又不内入于里，既不能从上越，又不能从下泄，稽留徘徊于少阳三焦，表现为寒热往来，或寒热起伏如疟状，胸腕痞闷或胸胁苦满，呕恶口苦，溲短，苔腻，脉弦等半表半里证。叶氏《温热论》所述"邪留三焦"，即指此种病机。章虚谷注曰："凡表里之气，莫不由三焦升降出入，而水道由三焦而行。故邪初入三焦，或胸胁满闷，或小便不利"。邪留三焦过久，必然引起胆热内炽。《通俗伤寒论》何秀山曰："足少阳胆与手少阳三焦，合为一经，其气化一寄于胆中以化水谷，一发于三焦以行腠理。若受湿热薰蒸，则三焦气机不畅，胆中相火乃炽"，都是对温病邪留少阳三焦病机的具体阐述。