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中華人民共和國成立後，於1951年，關幼波組織部分中醫師成立安定門聯合診所，並擔任所長。1952年至1953年，他先後參加了傳染病預防學習班和北京中醫學校進修班，學習西醫知識，為他以後運用中西醫兩種醫學理論研究各種疾病創造了條件。19 53年，他參加了北京市第一中醫門診部工作。1956年，被調到北京中醫醫院，曾任中醫師、內科副主任、內科主任、副院長等職。在此期間，他潛心研究肝病及各種疑難雜症，積累了大量的典型病例，結合個人30多年的臨床經驗和體會，於1979年編著發表了《關幼波臨床經驗選》。1978年，他與中醫醫院電子電腦室的科研人員合作，把自己的治療肝病的經驗編制成“關幼波肝病診療程序”，這項工作在中醫學的曆史上是一個創舉。
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